En residuos líquidos de origen domésticos del sistema aeróbico es típicamente usado para tratar  (DBO, DQO, etc) cuando es requerido remover nutrientes para cumplir limites más estrictos. Debe ser usado en tratamientos finales que viene después del tratamiento estándar

Existe varios sistemas dentro del tratamiento aeróbico. Uno es el SBR Reactor Batch en Sequencia en que por un sistema de cargas batch se hace el tratamiento. Este sistema funciona muy bien cuando existen grandes variaciones de caudales tal como condiminios de veraneo o invierno.

Otro sistema que encontramos es el de flujo continuo que necesita tener un flujo más parejo durante el año.

Finalmente al igual que los Riles se puede usar tratamiento aeróbico seguido por membranas. Esto derivará con un efluente de superior calidad.